Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFIP11Q9UBB9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms