Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms