Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDP1Q9P0J1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms