Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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