Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms