Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB6BQ9NRW1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms