Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXO8Q9NRD0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms