Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHX9Q9NQ69 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms