Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD3Q9NPG1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms