Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF3Q9H094 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms