Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC4A5Q9BY07 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms