Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.26■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms