Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TINF2Q9BSI4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms