Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM79Q9BSE2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms