Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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