Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms