Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms