Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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