Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MTERF3Q96E29 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms