Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC39Q96DD0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC39Q96DD0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms