Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC59Q96AG4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms