Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFT1Q96AA3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms