Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SDC2-203ENST00000519587 557 ntTSL 414.11□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DCP2-205ENST00000510046 369 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-209ENST00000562470 433 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-206ENST00000525781 2391 ntTSL 213.92□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 213.89□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 213.77□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KLHL22-209ENST00000479601 1389 ntTSL 513.59□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 COG3-203ENST00000476702 255 ntTSL 313.53□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 LDLRAD4-210ENST00000587600 444 ntTSL 313.29□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PCCA-215ENST00000637657 2118 ntTSL 513.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 213.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PACS2-211ENST00000551692 3453 ntTSL 213.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPR107-207ENST00000493417 2833 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DGKD-213ENST00000490764 2902 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DGKD-211ENST00000480535 453 ntTSL 312.81□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DCP2-203ENST00000504961 852 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C16orf58-204ENST00000564807 555 ntTSL 412.7□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATP11A-203ENST00000415301 550 ntTSL 412.7□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CSTF1-208ENST00000613138 562 ntTSL 412.34□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 OTUD7A-202ENST00000558371 1630 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-213ENST00000514288 576 ntTSL 412.27□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 312.24□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-218ENST00000636113 2981 ntTSL 512.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)12.1□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP152-210ENST00000561245 577 ntTSL 212.07□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP63-216ENST00000620544 1601 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 511.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PER2-202ENST00000355768 1228 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DNM2-214ENST00000590787 4299 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSBP3-210ENST00000525990 701 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MLLT10-211ENST00000471315 319 ntTSL 311.59□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 411.58□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TTLL3-222ENST00000459758 555 ntTSL 411.58□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-201ENST00000502433 609 ntTSL 411.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KLHL22-210ENST00000487090 596 ntTSL 311.46□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP192-204ENST00000507064 706 ntTSL 311.42□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CLSTN3-211ENST00000541667 671 ntTSL 411.38□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLC28A1-204ENST00000538177 2155 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TTLL3-206ENST00000419081 591 ntTSL 511.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SLC28A1-202ENST00000338602 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PYGB-202ENST00000428458 734 ntTSL 310.95□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 EHBP1-220ENST00000496857 1262 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AP005131.6-201ENST00000587344 4215 ntBASIC10.88□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-210ENST00000443197 4173 ntTSL 510.84□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KIF2C-207ENST00000480574 783 ntTSL 510.84□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-211ENST00000491685 852 ntTSL 510.82□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TCF19-202ENST00000376257 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 35.3
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 262.1 ms