Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms