Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED12Q93074 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED12Q93074 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED12Q93074 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED12Q93074 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED12Q93074 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED12Q93074 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms