Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD13Q8WZ19 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms