Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNRF4Q8WWF5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms