Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms