Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD1Q8NA66 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD1Q8NA66 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms