Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCL2Q8N4E4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCL2Q8N4E4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms