Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM5Q71RC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms