Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms