Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms