Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms