Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms