Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C5orf47Q569G3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms