Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDLIM3Q53GG5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms