Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDNFQ49AH0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDNFQ49AH0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms