Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms