Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2SQ16763 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2SQ16763 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms