Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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