Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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