Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CST6Q15828 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CST6Q15828 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CST6Q15828 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms