Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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