Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA2Q15822 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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