Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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