Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms