Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms