Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms