Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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